طراحی سیستم های مجازی بیان اسیدآمینه ی تریپتوفان در اشریشیاکلی با روشهای insilico

تریپتوفان یک اسید آمینه آروماتیک ضروری است که کاربرد گسترده ای در زمینه های مختلف مثل مکمل های غذایی انسان و دام، مواد دارویی مثل داروهای خواب آور،آرام بخش یا محلول رینگر و مواد بهداشتی دارد. باکتری اشرشیاکلی میزبانی با استفاده گسترده که دارای زمینه ی ژنتیکی شفاف و معلوم ، ابزارهای مهندسی متابولیک مناسب و در دسترس و رشد سریع در محیط کشت ارزان است ، توجه زیادی را برای تولید تریپتوفان و دیگر ترکیبات آروماتیک به خود جلب کرده است. دراین پروژه با در نظر گرفتن عناصر تنظیم کننده نسخه برداری در ناحیه ی پروموتوری و نقش احتمالی این عناصر در افزایش بیان ،الگوهای جدیدی از اپرون تریپتوفان اشریشیا کلی با تمرکز بر یکی از مهمترین قسمتهای آن یعنی ناحیه ی پروموتور ارائه شد. بدین منظور از آنالیزهای بیوانفورماتیکی برای ارزیابی پروموتورهای ارائه شده از لحاظ خصوصیات ساختاری انحنا وانعطاف پذیری وخصوصیات ترمودینامیکی پایداری و انرژی انباشت و همچنین فاکتور ناپایداری ناشی از فشار داپلکس (sidd) استفاده شده و بر پایه ی این خصوصیات 10 هسته ی پروموتوری برتر و 5 ناحیه ی فرادست پروموتور جهت استفاده در پروسه های آزمایشگاهی پیشنهاد گردید.